Rattachées juridiquement à Madagascar au début du XXème siècle, les Comores déclarent leur indépendance en 1975 tandis que Mayotte vote pour rester française en 1974.

Des accords de coopération en matière de culture et d'enseignement sont signés le 10 novembre 1978. La MCAC de Moroni ouvre ses portes en 1979-1980 et la présence d'un chef de mission est attestée dans les annuaires diplomatiques en 1980.

En 1999, à l'instar des services du ministère de la Coopération, la MCAC de Moroni ferme ses portes. Ses missions sont confiées au SCAC de Moroni qui reçoit les dossiers en cours de traitement.

Versements.

Fonds clos.

Les archives sont classées selon le plan le classement des archives des MCAC validé par le ministère de la coopération en 1997.

Au 31 décembre 1998, les MCAC ferment avec le ministere de la Coppération. Les missions du MINCOOP sont confiées au ministtèere des Affaires étrangères et les missions des MCAC sont confiées aux Services de doopération et d'action culturelle (SCAC).