La sous-série Afrique a été reclassée une première fois et inventoriée par Marie-Thérèse Denis, Denise Ozanam et Agnès Pouillon, sous la forme d'un répertoire numérique détaillé dactylographié. Toutefois, ce répertoire présentait quelques lacunes, erreurs, insuffisances dans l'identification des dossiers, et le plan de classement général par grandes régions géographiques ou thèmes (notamment : la traite des Noirs) n'apparaissait pas. De plus, un récolement de l'ensemble des dossiers permettait de voir que certains étaient manquants. Cette sous-série a donc été intégralement reprise et vérifiée en août 2006. Quelques dossiers ont été déplacés et remis à leur place logique ; un renvoi à la nouvelle cote a été faite à l'emplacement d'origine, sauf lorsque le changement était mineur (déplacement au sein d'un même carton). L'essentiel des changements a constitué dans la création de deux articles supplémentaires pour soulager certains cartons inadaptés à leur contenu : les dossiers 15 à 34 contenus dans l'article 4 et les dossiers 1 à 11 contenus dans l'article 5 ont été transférés dans un nouvel article 4bis ; les dossiers 20 à 38 contenus dans l'article 25 ont été transférés dans un nouvel article 25bis. Par ailleurs, le carton n°8 ayant été jugé trop gros, les dossiers concernant les colonies espagnoles ont été transférés de l'article 8 à l'article 9.

Complémentaires des séries Correspondance politique et Mémoires et documents, ces dossiers représentent en réalité non seulement les « affaires diverses » (voir mode de classement), mais le reliquat de l'ensemble des affaires traitées par la direction politique qui n'avaient pas fait l'objet d'une reliure dans l'ordre chronologique des pièces au sein de l'une ou l'autre de ces deux séries.

On trouve donc sur les chemises, qui sont le plus souvent d'origine, la mention de l'ancien classement : série « A », série « D », « affaires diverses », « affaires particulières » (concernant des particuliers), « transmissions » (correspondance avec les autres administrations), « autographies » (pièces copiées et/ou légalisées)&

A un premier classement par grandes zones géographiques (articles 1 à 25 bis) succède un classement thématique avec un vaste ensemble de dossiers concernant la répression de la traite des Noirs (article 26 à 41) suivi de deux cartons sur le recrutement des travailleurs noirs libres.

Au sein de ce classement, les dossiers sont ordonnés par ordre chronologique.

L'appellation « affaires diverses » correspond à un mode de classement particulier de certains dossiers traités par la direction politique : affaires souvent contentieuses, impliquant généralement des particuliers, s'étendant sur plusieurs années. De ce fait, le classement strictement chronologique qui a été appliqué n'a abouti qu'à scinder bien souvent les dossiers. D'autres en revanche sont restés groupés.

Enfin il convient de noter que la numérotation des dossiers, à l'intérieur des articles, ne correspond pas toujours à un ordre reflétant le classement d'origine. Au contraire, la plupart du temps, cette numérotation est récente ; elle remonte principalement au premier classement par M-T Denis, D. Ozanam et A. Pouillon ; dans certains cas elle est même postérieure et n'a donc qu'une valeur relative.

Répertoire numérique détaillé par Françoise WATEL, conservateur en chef du Patrimoine, Paris, août 2006, 51 p. Voir l'inventaire.