Chargé du ministère des Affaires étrangères et président du Conseil
1) du 28/12/1879 au 23/09/1880
2) du 30/01/1882 au 07/08/1882
3) du 08/04/1885 au 07/03/1886 (Affaires étrangères seules)
4) du 08/01/1886 au 11/12/1892
et président du Conseil
du 17/03/1890 au 27/02/1892

En 1928, deux pièces ont été restituées sur sa demande à Melle de Freycinet, héritière de son père. Ces pièces, une lettre du prince-président à M. Lefèbvre-Durufle, datée du 1er décembre 1851 et lui annonçant le coup d'Etat, une lettre écrite par Crémieux à Freycinet, datée de février 1871, ont été par la suite offertes par Melle de Freycinet au musée de l'Ecole polytechnique.
La même année, M. Rigault, alors conservateur des Archives, renvoyait à Melle de Freycinet un dossier relatif à la crise ministérielle de 1880 et également à la correspondance échangée entre Freycinet et Ribot au sujet de l'alliance franco-russe. Il se faisait donner, en échange, trois lettres de Jules Ferry, de l'archevêque de Paris et du nonce, ainsi qu'une courte note de Freycinet relative à la question des congrégations.

Dès le 17 mai 1923, c'est-à-dire deux jours après le décès de Freycinet, les scellés ont été apposés au domicile du ministre. M. de Billy, a été désigné par le département pour assister à la levée des scellés. A la suite de cette opération, 7 cartons de documents ont été pris en charge par le service des archives au titre de papiers d'État.

Librement communicables.

Répertoire numérique détaillé par J. de Pins, archiviste (1958), et J. Ch. Allain, professeur au lycée Jeanson de Sailly à Paris (1965), 24 p.  Voir l'instrument de recherche

À la bibliothèque centrale de l'Ecole polytechnique à Palaiseau (Essonne) :

• Une correspondance entre Gambetta et Freycinet au sujet des mouvements à prescrire à Garibaldi.
• Une correspondance au sujet de l'armistice, avec la notification de Bismarck à la délégation de Bordeaux.
• Les conventions passées entre les autorités prussiennes et le corps du commandant Bernard opérant dans les Vosges.